正如人們知道的用高壓水槍能夠容易地沖洗干凈汽車等，適當壓力的水流早已被證明能有效地清潔人們的牙齒和口腔. 沖牙器的清潔作用主要是利用在一定壓力下噴射出來的高速水柱的沖擊力來實現(xiàn)的. 在主要靠水流本身的沖擊力的基礎上，下面措施可能進一步提高清潔效果:
　　1)使水流以適當?shù)拿}沖形式噴射沖擊，或使水流中帶入較多氣泡也能有類似的振動沖擊作用;
　　2)給水流中添加一些不同功能的助劑，例如加入微細的硬重砂粒以形成無數(shù)顆高速"子彈"，或加入一些增加清潔功能的表面活性劑等. 水柱的沖擊清潔能力還與水柱大小有關(guān)系;
　　3) 通過改變水流脈沖的頻率，達到與壓力的最佳組合。 例如牙科診所的專業(yè)洗牙機就是2萬次以上的高頻，從利用頻率震動清洗物體的原理上看，頻率越高，清洗效果越好。
　　沖牙器所需的水壓主要有兩種來源:
　　1)用自帶電泵產(chǎn)生水壓;
　　2)直接利用自來水的壓力. 所以沖牙器按結(jié)構(gòu)可主要分為電動沖牙器和水龍頭沖牙器兩大類. 電動沖牙器的結(jié)構(gòu)主要有一個電動水泵，儲水槽，噴頭. 水龍頭沖牙器的結(jié)構(gòu)主要有一個與水龍頭的連接裝置和噴頭.
　　牙齒與牙齦交界處有一個約2毫米深的圍繞牙齒但沒有附著在牙齒的溝叫牙齦溝. 這是通向牙齒根基的最重要交界處但卻最易藏污納垢，是最容易引起牙齒及牙齦疾病的地方. 牙齦溝和牙縫是兩個最不易清潔的地方，有研究指出"有多達40%的牙齒表面無法用牙刷清潔". 雖然用牙線(或牙簽)能夠清除牙齒表面堆積物，但微觀上看，凸凹不平的牙齒表面仍然會不清潔.細菌生長只需極薄的一層營養(yǎng)膜即可，殘存的臟物膜的有害作用也仍然部分存在. 既有摧枯拉朽的強力又能鉆縫入孔的壓力水流從原理上講是最理想的口腔清潔方式. 據(jù)美國有關(guān)機構(gòu)研究，壓力水柱能沖進牙齦溝沖洗到50-90%的深度. 壓力水柱不僅能清潔到各種縫隙孔洞和凸凹崎面，而且其效果可以達到微觀的徹底"清潔"而不只是宏觀的粗略"清除". 沖牙器除有清潔牙齒口腔的功能外，水流對牙齦還有按摩作用，促進牙齦的血液循環(huán)增強局部組織抗病力; 同時還能消除因口腔衛(wèi)生差產(chǎn)生的口臭.塞在牙齒縫里的食物殘屑，除了讓人不舒服和本身帶有細菌外，更大的害處在于它給牙菌斑提供營養(yǎng)物質(zhì)。如不及時清除，牙菌斑很容易鈣化，變成"牙石"積聚在牙根部，壓迫和刺激牙周環(huán)境，使牙周萎縮。因此，用沖牙器或牙簽、牙線來清理牙縫，其實就是阻斷牙菌斑的一個主要營養(yǎng)來源。